Comparison of Structures of Crystalline Solids Predicted using PM6 with X-Ray (Home)

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3 1,4-diazabicyclo[2.2.2]octane azelaic acid

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Notes: This system is essentially the same as the 1-diazonia-4-azabicyclo[2.2.2]octane_glutarate.

                      Unit Cell Parameters:       a      b      c   alpha   beta  gamma   Volume  Density
                                     X-Ray:    28.15   8.60   6.98  90.00  93.00  90.00   1687.4   1.182
                                       PM6:    30.36   8.33   5.93  91.10  89.13  91.34   1499.3   1.331

                 X-Ray                               PM6

For X-Ray structure, contact the CCDC: http://www.ccdc.cam.ac.uk/

Optimized PM6 data set: MERS=(1,1,1) GNORM=5 1,4-diazabicyclo[2.2.2]octane azelaic acid O 0.03657557 +1 0.0274085 +1 -0.2520226 +1 0.0000 O -13.86691937 +1 -2.7979173 +1 -12.6671074 +1 0.0000 C -12.83288537 +1 -2.6330962 +1 -13.3367669 +1 0.0000 C -11.56956758 +1 -2.0126672 +1 -12.7946736 +1 0.0000 H -11.44719324 +1 -0.9998947 +1 -13.2655500 +1 0.0000 H -10.69104443 +1 -2.5720057 +1 -13.1917211 +1 0.0000 C -11.50466788 +1 -1.9151884 +1 -11.2691722 +1 0.0000 H -12.40634965 +1 -2.3899216 +1 -10.8134940 +1 0.0000 H -11.55549784 +1 -0.8452962 +1 -10.9687342 +1 0.0000 C -10.22271765 +1 -2.5586214 +1 -10.7288923 +1 0.0000 H -10.36479914 +1 -3.6539241 +1 -10.6300395 +1 0.0000 H -9.39498143 +1 -2.4465866 +1 -11.4740934 +1 0.0000 C -9.77247732 +1 -1.9737921 +1 -9.3852235 +1 0.0000 H -10.50475923 +1 -2.2482707 +1 -8.5876994 +1 0.0000 H -9.77687309 +1 -0.8681178 +1 -9.4174842 +1 0.0000 C -8.37011744 +1 -2.4825088 +1 -9.0330472 +1 0.0000 H -8.35339890 +1 -3.5978478 +1 -9.1065091 +1 0.0000 H -7.63791949 +1 -2.1359091 +1 -9.7959637 +1 0.0000 C -7.91889756 +1 -2.0457210 +1 -7.6349641 +1 0.0000 H -7.89695290 +1 -0.9424548 +1 -7.5597198 +1 0.0000 H -8.66451086 +1 -2.3848972 +1 -6.8724011 +1 0.0000 C -6.53904341 +1 -2.6333938 +1 -7.3277428 +1 0.0000 H -6.59910593 +1 -3.7612367 +1 -7.3382009 +1 0.0000 H -5.80701806 +1 -2.3924499 +1 -8.1461815 +1 0.0000 C -5.99064788 +1 -2.1934877 +1 -6.0121832 +1 0.0000 O -6.58975617 +1 -1.9424171 +1 -4.9771187 +1 0.0000 O -4.64257867 +1 -2.0952884 +1 -6.0296096 +1 0.0000 C 11.49510967 +1 -1.3104276 +1 11.7900822 +1 0.0000 H 12.56256025 +1 -1.2635149 +1 11.4598585 +1 0.0000 H 11.32390492 +1 -0.3840886 +1 12.3938513 +1 0.0000 C 10.53085275 +1 -1.3784983 +1 10.5889933 +1 0.0000 H 9.89391860 +1 -0.4571700 +1 10.5416920 +1 0.0000 H 11.08893357 +1 -1.4358058 +1 9.6275693 +1 0.0000 C 9.88109456 +1 -2.5463493 +1 13.1899208 +1 0.0000 H 9.72311820 +1 -1.6622916 +1 13.8496585 +1 0.0000 H 9.72243251 +1 -3.4415597 +1 13.8272810 +1 0.0000 C 8.90413889 +1 -2.5350495 +1 11.9917997 +1 0.0000 H 8.20165669 +1 -3.4029883 +1 12.0414872 +1 0.0000 H 8.26260036 +1 -1.6137756 +1 12.0250271 +1 0.0000 C 11.52819723 +1 -3.7839293 +1 11.8282252 +1 0.0000 H 11.43510579 +1 -4.6967484 +1 12.4736901 +1 0.0000 H 12.57667023 +1 -3.7837657 +1 11.4397354 +1 0.0000 C 10.49757698 +1 -3.8195050 +1 10.6792820 +1 0.0000 H 11.00200037 +1 -3.9046132 +1 9.6824119 +1 0.0000 H 9.83672353 +1 -4.7168592 +1 10.7797198 +1 0.0000 N 11.31107753 +1 -2.5371390 +1 12.6685497 +1 0.0000 N 9.64167662 +1 -2.5854357 +1 10.6860411 +1 0.0000 H -4.25841612 +1 -1.7808331 +1 -5.0597411 +1 0.0000 H 12.13393097 +1 -2.4827299 +1 13.5341844 +1 0.0000 O 13.42081830 +1 -2.1293792 +1 14.0380442 +1 0.0000 O -0.83492392 +1 -1.1497067 +1 1.3990736 +1 0.0000 C 0.12906159 +1 -0.5436127 +1 0.9069424 +1 0.0000 C 1.47285697 +1 -0.3933203 +1 1.5795584 +1 0.0000 H 2.22986920 +1 -0.9630331 +1 0.9890853 +1 0.0000 H 1.79803041 +1 0.6698100 +1 1.4881395 +1 0.0000 C 1.49742400 +1 -0.8433766 +1 3.0393548 +1 0.0000 H 0.73567300 +1 -0.2719779 +1 3.6232767 +1 0.0000 H 1.18446258 +1 -1.9108370 +1 3.1124673 +1 0.0000 C 2.89572336 +1 -0.6394369 +1 3.6258225 +1 0.0000 H 3.04325920 +1 0.4401190 +1 3.8279115 +1 0.0000 H 3.66785023 +1 -0.9126683 +1 2.8656666 +1 0.0000 C 3.16019135 +1 -1.4371799 +1 4.9074231 +1 0.0000 H 2.33154951 +1 -1.2998042 +1 5.6412819 +1 0.0000 H 3.18128652 +1 -2.5279542 +1 4.6984528 +1 0.0000 C 4.49411095 +1 -0.9851087 +1 5.5135085 +1 0.0000 H 4.38164122 +1 0.0511448 +1 5.9125823 +1 0.0000 H 5.26353557 +1 -0.9212725 +1 4.7152136 +1 0.0000 C 5.00072626 +1 -1.9063201 +1 6.6280263 +1 0.0000 H 5.04816415 +1 -2.9614005 +1 6.2707301 +1 0.0000 H 4.27878770 +1 -1.9235813 +1 7.4731502 +1 0.0000 C 6.38208759 +1 -1.4278200 +1 7.0857579 +1 0.0000 H 6.30784887 +1 -0.3724849 +1 7.4702624 +1 0.0000 H 7.09509703 +1 -1.3617393 +1 6.2171925 +1 0.0000 C 6.98771760 +1 -2.2687603 +1 8.1592431 +1 0.0000 O 6.46030829 +1 -3.0654076 +1 8.9146504 +1 0.0000 O 8.31478854 +1 -2.0070226 +1 8.2851936 +1 0.0000 C -1.68418256 +1 -1.9615306 +1 -2.0994323 +1 0.0000 H -0.61248135 +1 -2.0144552 +1 -2.4180455 +1 0.0000 H -1.78454089 +1 -2.6419889 +1 -1.2187250 +1 0.0000 C -2.62403854 +1 -2.4034765 +1 -3.2386561 +1 0.0000 H -3.24273380 +1 -3.2740707 +1 -2.9148078 +1 0.0000 H -2.03977478 +1 -2.7507530 +1 -4.1332137 +1 0.0000 C -3.47390972 +1 -0.4844047 +1 -1.2772615 +1 0.0000 H -3.63394335 +1 -1.1793143 +1 -0.4208292 +1 0.0000 H -3.72972925 +1 0.5273874 +1 -0.8852442 +1 0.0000 C -4.35667082 +1 -0.8635609 +1 -2.4883572 +1 0.0000 H -5.01251271 +1 -0.0011163 +1 -2.7885837 +1 0.0000 H -5.05169291 +1 -1.7031685 +1 -2.2324570 +1 0.0000 C -1.80803665 +1 0.3896902 +1 -2.8782447 +1 0.0000 H -2.06360350 +1 1.4396851 +1 -2.5842710 +1 0.0000 H -0.72152836 +1 0.4004448 +1 -3.1445039 +1 0.0000 C -2.66359726 +1 -0.0960120 +1 -4.0662546 +1 0.0000 H -2.01414157 +1 -0.4110612 +1 -4.9211372 +1 0.0000 H -3.31940009 +1 0.7146637 +1 -4.4468009 +1 0.0000 N -2.01096510 +1 -0.5339453 +1 -1.6891948 +1 0.0000 N -3.51500068 +1 -1.2702679 +1 -3.6640723 +1 0.0000 H 8.74166693 +1 -2.4921300 +1 9.1132207 +1 0.0000 H -1.26211521 +1 -0.2093677 +1 -0.8254553 +1 0.0000 O 2.44827518 +1 2.9842444 +1 -0.1628822 +1 0.0000 O 3.29635737 +1 3.5639783 +1 -2.1265042 +1 0.0000 C 2.34129335 +1 3.1732327 +1 -1.4407751 +1 0.0000 C 0.96510983 +1 2.8899864 +1 -1.9937871 +1 0.0000 H 0.54569892 +1 1.9871871 +1 -1.4869594 +1 0.0000 H 0.29074462 +1 3.7138199 +1 -1.6648691 +1 0.0000 C 0.91302018 +1 2.7348313 +1 -3.5144160 +1 0.0000 H 1.81733901 +1 3.1950343 +1 -3.9811271 +1 0.0000 H 0.96381520 +1 1.6545467 +1 -3.7766432 +1 0.0000 C -0.36783567 +1 3.3666330 +1 -4.0652306 +1 0.0000 H -0.22757310 +1 4.4618097 +1 -4.1732220 +1 0.0000 H -1.19874868 +1 3.2577271 +1 -3.3222042 +1 0.0000 C -0.81531455 +1 2.7741832 +1 -5.4049619 +1 0.0000 H -0.08945035 +1 3.0502597 +1 -6.2080717 +1 0.0000 H -0.80619249 +1 1.6688264 +1 -5.3718527 +1 0.0000 C -2.22106728 +1 3.2823976 +1 -5.7423785 +1 0.0000 H -2.24432081 +1 4.3961015 +1 -5.6404175 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